L’indication de la PBH doit être bien définie et le bénéfice pour le malade  des renseignements escomptés de la biopsie doit dépasser le risque de l’examen. L’apport de la PBH dépend donc essentiellement de la pertinence de l’indication.
Sa participation au diagnostic reste essentielle dans certaines situations telles que
-Les cytolyses inexpliquées
-L’hépatite auto-immune
-L’hépatite alcoolique aiguë dont le diagnostic est porté à tort dans 25% des cas en l’absence de PBH
-L’association de plusieurs causes d’hépatopathie (alcool, virus, insulino-résistance, fer…)
-Les cholestases intra-hépatiques chroniques
Dans un objectif pronostique, elle peut apprécier le stade évolutif d’une maladie hépatique chronique :
-Mettre en évidence une cirrhose dont le diagnostic justifie des mesures de surveillance spécifiques
-Déterminer le stade de fibrose pour l’indication de traitement des hépatites virales chroniques.

La   morbidité se situe entre 3 et 5,7/1000 PBH et la mortalité entre 1 et 3/10.000 PBH. Le risque de complications modérées ou sévères, augmente avec le nombre de passages, et  diminue avec l’expérience de l’opérateur, le contrôle échographique et, bien entendu le respect des recommandations pour la pratique clinique (GCB, 2002 ; 26 :848-78)

Il s’agit de la probabilité d’obtenir une réponse exacte à la question posée.
Elle est bien entendu influencée par l’expérience de l’anatomo-pathologiste.
Le résultat peut être faussé par la répartition parfois hétérogène des lésions dans le parenchyme hépatique, limitant la « représentativité » de l’échantillon prélevé. La taille du prélèvement doit être suffisante pour permettre une interprétation fiable : classiquement, la taille requise était  de 1 à 1,5 cm avec au moins 5 à 6 espaces portes. Les exigences sont actuellement plus grande : 20 mm et/ou 11 espaces portes, ou 25mm.

La PBH reste une technique indispensable au diagnostic de certaines  hépatopathies, utile à l’estimation du stade de fibrose, mais présente

ses résultats n’étant pas d’une fiabilité absolue
Ces limites existent aussi bien dans le contexte diagnostique (des lésions irrégulièrement réparties peuvent être méconnues si le prélèvement a porté sur une zone indemne de ces lésions), que pronostique : la fibrose peut être largement sous-estimée sur un prélèvement fragmenté, ou si elle est irrégulièrement répartie.  

liés à l’obligation d’hospitalisation, et au coût qui lui est de ce fait associé

certainement surestimés mais néanmoins présents